Дизайн ингибиторов активного центра тирозил-тРНК синтетазы Mycobacterium tuberculosis на основе ингибитора SB-219383

Микуляк, ВВ
Дубей, ИЯ
Dopov. Nac. akad. nauk Ukr. 2014, 10:167-174
https://doi.org/10.15407/dopovidi2014.10.167
Раздел: Биофизика
Язык: Украинский
Аннотация: 

Тирозил-тРНК синтетаза Mycobacterium tuberculosis (MtTyrRS) является одним из ключевых ферментов синтеза белка на дорибосомном этапе, поэтому его ингибирование должно существенно сдерживать рост патогенных бактерий в организме хозяина. MtTyrRS и TyrRS человека не способны к перекрестному распознаванию и аминоацилированию соответствующих тРНКTyr, поэтому специфические ингибиторы MtTyrRS должны быть не токсичными для человека. Взаимодействие ингибитора с каталитической KMSKS-подобной петлей MtTyrRS должно существенно повысить его аффинность к ферменту. С учетом этого проведен дизайн новых ингибиторов MtTyrRS на основе структуры известного ингибитора SB-219383. Модификация осуществлялась таким образом, чтобы обеспечить взаимодействие ингибиторов с каталитической петлей фермента. Показано, что смоделированные нами ингибиторы взаимодействуют с каталитической петлей на протяжении всего времени динамики MtTyrRS (100 нс).

Ключевые слова: Mycobacterium tuberculosis