Мас-спектрометричний аналіз олігорибонуклеотидів сумарної дріжджової РНК
DOI:
https://doi.org/10.15407/dopovidi2021.02.115Ключові слова:
дріжджова РНК, рибонуклеотиди, рідинна хроматографія, мас-спектрометрія MALDI-Tof-TofАнотація
Досліджено олігорибонуклеотидний склад сумарної дріжджової РНК, що входить до складу противірусно- го препарату широкого спектра дії Нуклекс. Для аналізу природних рибонуклеотидів використано методи рідинної хроматографії та мас-спектрометрії MALDI-Tof-Tof. У складі сумарної дріжджової РНК вста- новлено три основні фракції: перша — від 2 до 4 нуклеотидів, друга — від 4 до 7, третя — від 10 до 15. Зробле- но висновок, що досліджувана РНК містить олігорибонуклеотиди різної довжини, а саме від 4 до 15 ланок.
Завантаження
Посилання
Sullenger, B.A. & Gilboa, E. (2002). Emerging clinical applications of RNA. Nature, 418, pp. 252-258. https://doi.org/10.1038/418252a
Biesecker, G., Dihel, L., Enney, K. & Bendele, R.A. (1999). Derivation of RNA aptamer inhibitors of human complement C5. Immunopharmacology, 42, № 1-3, pp. 219-230. https://doi.org/10.1016/s0162-3109(99)00020-x
Sundaram, P., Kurinawan, H., Byrne, M.E. & Wower, J. (2013). Therapeutic RNA aptamers in clinical trials. Eur. J. Pharm. Sci., 48, pp. 259-271. https://doi.org/10.1016/j.ejps.2012.10.014
Burnett, J.C. & Rossi, J.J. (2012). RNA-based therapeutics: current progress and future prospects. Chem. Biol., 19, pp. 60-71. https://doi.org/10.1016/j.chembiol.2011.12.008
Pat. 8722642 B2 US, Multiantivirus compound, composition and method for treatment of virus diseases, Tkachuk, Z. Publ. 13.05.2014.
Keefe, A.D., Pai, S. & Ellington, A. (2010). Aptamers as therapeutics. Nat. Rev. Drug Discov., 9, pp. 537-550. https://doi.org/10.1038/nrd3141
Thomas, B. & Akoulitchev, A.V. (2006). Mass spectrometry of RNA. Trends Biochem. Sci., 31, № 3, pp. 173-181. https://doi.org/10.1016/j.tibs.2006.01.004
Banoub, J.H., Newton, R.P., Esmans, E., Ewing, D.F. & Mackenzie, G. (2005). Recent developments in mass spectrometry for the characterization of nucleosides, nucleotides, oligonucleotides, and nucleic acids. Chem. Rev., 105, № 5, pp. 1869-1916. https://doi.org/10.1021/cr030040w
Chiang, C.-K., Yang, Z., Lin, Y.-W., Chen, W.-T., Lin, H.-J. & Chang H.-T. (2010). Detection of proteins and protein−ligand complexes using HgTe nanostructure matrixes in surface-assisted laser desorption/ionization mass spectrometry. Anal. Chem., 82, № 11, pp. 4543-4550. https://doi.org/10.1021/ac100550c
Jiménez, C.R., Huang, L., Qiu, Y. & Burlingame A.L. (2001). Sample preparation for MALDI mass analysis of peptides and proteins. Curr. Protoc. Protein Sci., Chapter 16, Unit 16.3. https://doi.org/10.1002/0471140864.ps1603s14
Apffel, A., Chakel, J.A., Fischer, S., Lichtenwalter, K. & Hancock, W.S. (1997). Analysis of oligonucleotides by HPLC-electrospray ionization mass spectrometry. Anal. Chem., 69, № 7, pp. 1320-1325. https://doi.org/10.1021/ac960916h
Huth-Fehre, T., Gosine, J.N., Wu, K.J. & Becker, C.H. (1992). Matrix-assisted laser desorption mass spectrometry of oligodeoxythmidylic acids. Rapid Commun. Mass Spectrom., 6, № 3, pp. 209-213. https://doi.org/10.1002/rcm.1290060312
Nordhoff, E., Ingendoh, A., Cramer, R., Overberg, A., Stahl, B., Karas, M., Hillenkamp, F., Crain, P.F. & Chait, B. (1992). Matrix-assisted laser desorption/ionization mass spectrometry of nucleic acids with wavelengths in the ultraviolet and infrared. Rapid Commun. Mass Spectrom., 6, № 12, pp. 771-776. https://doi.org/10.1002/rcm.1290061212
Pieles, U., Zürcher, W., Schär, M. & Moser, H.E. (1993). Matrix-assisted laser desorption ionization time-offlight mass spectrometry: a powerful tool for the mass and sequence analysis of natural and modified oligonucleotides. Nucleic Acids Res., 21, № 14, pp. 3191-3196. https://doi.org/10.1093/nar/21.14.3191
##submission.downloads##
Опубліковано
Як цитувати
Номер
Розділ
Ліцензія
Авторське право (c) 2021 Доповіді Національної академії наук України
Ця робота ліцензується відповідно до Creative Commons Attribution-NonCommercial 4.0 International License.
