ЕВОЛЮЦІЙНИЙ ТРАНЗИТИВНО-ТРАНСВЕРСИВНИЙ ЗСУВ НА ПРИКЛАДІ ГЕНА CYTB ПАЛЕАРКТИЧНИХ MURIDAE (RODENTIA) I VESPERTILIONIDAE (CHIROPTERA)
DOI:
https://doi.org/10.15407/dopovidi2023.02.093Ключові слова:
еволюційний ts/tv зсув, Muridae, Vespertilionidae, молекулярна еволюція, молекулярний годинникАнотація
Порівняльний аналіз особливостей транзитивно-трансверсивного зсуву нуклеотидної послідовності гена cуtb гладконосих (Vespertilionidae, Chiroptera) і мишачих (Muridae, Rodentia) показує як загальні закономірності, так і певні особливості родинного рівня. Загальними для двох родин є факт різкого переважання переходів над трансверсіями на ранніх етапах еволюційного процесу з наступним вирівнюванням ts/tv- зміщення на видовому та родовому рівнях дивергенцій, а також та обставина, що зростання частоти транзицій у філетичних рядах носить поступовий характер, а транзицій — стрибкоподібний. При цьому рівень спонтанного мутування та еволюційного зсуву, а також швидкість компенсації ts/tv зсуву є специфічними для родин. Ці обставини не дають можливості отримати порівнянні оцінки дивергенції в різних філумах і спричиняють непереборні труднощі для створення універсальної формули молекулярних годин.
Завантаження
Посилання
Zuckerkandl, E. & Pauling, L. (1962). Molecular disease, evolution, and genic heterogeneity. In Kasha, M. & Pullman, B. (Ed.). Horizons in biochemistry (pp. 189-225). New York: Academic Press.
Pesole, G., Gissi, C., De Chirico, A. & Saccone, C. (1999). Nucleotide substitution rate of mammalian mito- chondrial genomes. J. Mol. Evol., 48, No. 4, pp. 427-434. https://doi.org/10.1007/PL00006487
Kumar, S. (2005). Molecular clocks: four decades of evolution. Nat. Rev. Genet., 6, No. 8, pp. 654-662. https://doi.org/10.1038/nrg1659
Huang, S. (2008). The genetic equidistance result of molecular evolution is independent of mutation rates. J. Comp. Sci. Syst. Biol., 1, pp. 92-102. https://doi.org/10.4172/jcsb.1000009
Ho, S. Y. W. & Duchene, S. (2014). Molecular-clock methods for estimating evolutionary rates and times- cales. Mol. Ecol., 23 (24), pp. 5947-5965. https://doi.org/10.1111/mec.12953
Collins, D. W. & Jukes, T. H. (1994). Rates of transition and transversion in coding sequences since the hu- man-rodent divergence. Genomics, 20, Iss. 3, pp. 386-396. https://doi.org/10.1006/geno.1994.1192
Belle, E. M. S., Piganeau, G., Gardner, M. & Eyre-Walker, A. (2005). An investigation of the variation in the transition bias among various animal mitochondrial DNA. Gene, 355, Iss.1, pp. 58-66. https://doi.org/10.1016/j.gene.2005.05.019
Duchene, S., Ho, S. Y. & Holmes, E. C. (2015). Declining transition/transversion ratios through time reveal limitations to the accuracy of nucleotide substitution models. BMC Evol. Biol., 15, 36. https://doi.org/10.1186/s12862-015-0312-6
Fitch, W. M. (1967). Evidence suggesting a non-random character to nucleotide replacements in naturally occurring mutations. J. Mol. Biol., 26, Iss. 3, pp. 499-507. https://doi.org/10.1016/0022-2836(67)90317-8
Kumar, S. (1996). Patterns of nucleotide substitution in mitochondrial protein coding genes of vertebrates. Genetics, 143, Iss. 1, pp. 537-48. https://doi.org/10.1093/genetics/143.1.537
Ebersberger, I., Metzler, D., Schwarz, C. & Pääbo, S. (2002). Genomewide comparison of DNA sequences between humans and chimpanzees. Am. J. Hum. Genet., 70, Iss. 6, pp. 1490-1497. https://doi.org/10.1086/340787
##submission.downloads##
Опубліковано
Як цитувати
Номер
Розділ
Ліцензія
Авторське право (c) 2023 Доповіді Національної академії наук України
Ця робота ліцензується відповідно до Creative Commons Attribution-NonCommercial 4.0 International License.
