На основі аналізу послідовностей гена 16S рРНК встановлено, що штам Pseudomonas batumici УКМ В-321 утворює окрему гілку всередині роду Pseudomonas з еволюційно близькими до нього видами P. gingeri і P. baetica — 98% подібності послідовностей гена 16S рРНК. Відмінності між наведеними видами, встановлені поліфазним таксономічним аналізом, полягають в наявності ряду ферментів, здатності до пігментоутворення, спектрах вуглецевого живлення, вмісту жирних кислот, антагоністичній активності. Синтез антистафілококового антибіотика батуміну виявлений тільки у P. batumici і, вірогідно, є унікальною особливістю штамів цього виду.